Rinnegan 1 poziom
Rinnegan to ograniczenie więzów krwi Rikudou Sennin. Rikudou Sennin był przedstawiony jako pierwotny shinobi, a jego doujutsu traktowane jako najpotężniejsze z trzech wielkich doujutsu. Przy pierwszym poziomie możliwa jest kontrola pogody. Użytkownik może robić co tylko chce ze zjawiskami atmosferycznymi. Drugą ciekawą zaletą pierwszego poziomu jest posiadanie dwóch ciał. Kiedy pierwsze zginie w walce, można przenieść sie do ciała drugiego, który posiada te same umiejętności co pierwowzór. Poziom ten pozwala takrze na rozróżnianie rzeczy niewidzialnych, oraz rozpoznawanie klonów od pierwowzorów.

Rinnegan 2 poziom
Na drugim poziomie użytkownik Rinnegana może kontrolować 4 ciała, które posiadają te same zdolności co on sam, to samo tyczy sie też unikalnych broni i umiejętności. Ma także możliwość dwa razy na walkę spowolnienia czasu co daje mu czas na atak lub na obronę przed atakiem.

Rinnegan 3 poziom
Ostateczny poziom Rinnegana. Na tym poziomie użytkownik może kontrolować 6 ciał, które posiadają te same cechy, bronie i umiejętności co oryginał. Na tym zaawansowanym poziomie posiadacz tego Kekei Genkai może jednym spojrzeniem zniszczyć ciało przeciwnika od środka (inne Doujutsu jaka tako tamują przebieg tej akcji), jednym spojrzeniem. Możliwość kontroli czasu jest nieograniczona. Ten poziom może osiągnąć tylko przywódca klanu.